西佳敬（北野武饰）是一名警察，几年前女儿不幸死去，如今妻子（岸本加世子饰）患白血病已到早期。好意让他去探望妻子的伙伴堀部（大杉涟饰），则在义务中严重受伤，招致下半身瘫痪，与轮椅为伴。后来西在一次拘捕举动中处置恰当，又招致后代田中（芦川诚饰）丧生。引咎辞职的他，想着供养田中的寡妻（大家由佑子饰），接近并抚慰老友堀部，黑社会紧追着他索讨利息，这一切都令西感到不堪重负。他决议铤而走险，做件冒险的事情

愁云惨淡的明治时代，曾遭到新政府运用和背叛的志志雄真实（池田政典配音）从天堂活转，而今他的阴影掩盖在和闰年代的上空。似乎与此同时，绯村剑心（凉风真世配音）以及同伴们皆明了志志雄的真正目的，即运用京都大火的混乱进军大阪。以此为契机，剑心、斋藤、相乐左之助分头向大阪挺进，而薰、弥彦、比谷清十郎以及京都御庭番众则留守警戒，随时迎接志志雄爪牙的入侵。濑田宗次郎、破军、四乃森苍紫等绝世高手相继退场，与原作大

幕末时期，维新派在传奇的刽子手拔刀斋绯村剑心（凉风真世配音）引退后，选出异常具有拙劣剑术的志志雄真实（池田政典配音）继续着暗杀义务。在维新行将取得成功之际，为掩盖种种不可告人的秘密，新政府密谋杀害志志雄。谁知全身遭到重度烧伤的志志雄却从天堂活转，怀着庞大的仇恨制定了“京都破坏方案”，他的手下网罗了四乃森苍紫、濑田宗次郎、宇水、张等一大批高手。与此同时，剑心、京都御庭番众、斋藤、比谷清十郎纷繁举动起

明治政府建立二十余年，新时代虽已来临，却似乎与人们心中——尤其是维新志士心中的那个理想国度相差甚远。国家仍处在大时代的动荡惶恐之中，战争的阴影仍笼罩在日本的上空。当年的浪漫剑客如今纷纷尘埃落定：弥彦成长为正直善良的剑客；左之助也少却了青春孟浪，变得沧桑；剑心的儿子剑路同样拜入比古清十郎的门下，誓要成为绝世高手，却与父亲分外隔膜；剑心接受政府的任务赶赴大陆战场，为了赎回前半生的罪过而疲于奔命，逆刃刀