故事发作在东京八丈岛远洋，这里建成了一座衔接了全球各地警方监控摄像的陆地设备“太平洋浮标”。在这座设备正式启动之前，为了与欧洲刑警组织管辖的范围联网，世界各国的IT工程师分开现场。而与此同时，一项运用了人脸识别系统的“新技术”的测试也在中止中……　　另一方面，柯南和少年侦探团在园子的招待上去到八丈岛赏鲸。此时，柯南接到来自冲矢昂（赤井秀一）的电话，原告知欧洲刑警组织的成员在德国遭到琴酒的杀害。