特利迦奥特曼与黑暗巨人的战役终了数年之后，地球再次迎来了战争的年代。如今曾经基本见不到怪兽的踪影了，怪兽带来的灾祸影响也曾经渐渐地淡出了人们的视野。人类曾经开拓了火星移居地，并方案组建新的队伍开拓第二个火星移居地。\n地球上的人类末尾了探求宇宙的征程，如今进入了新范围时代。结果，在探求的进程中，宇宙微妙生命体斯非亚突然出如今了主人公明日见奏大所在的小队面前。斯菲亚对地球发起了侵略，并隔绝地球和宇宙